Soviel mir bekannt ist, soll man die Karten immer mit der Software der Kamera löschen oder formatieren. also in der Kamera.
Ich hatte zu meinen Canon-Zeiten auch mal Schwierigkeiten, da ich mit PC formatiert hatte, das war der Fehler.
Warum soll man die Karten in der Kamera löschen?
Deine Erfahrung mit dem Formatieren kommen daher, daß die damaligen Windowsversionen nicht mit den Besonderheiten der Flashspeicher umgehen konnten. Du hättest ein spezielles Programm zum Formatieren benutzen müssen. Aber das Löschen und Schreiben wird vom Kontroller der Karte erledigt.