Da ich beide Objektive über ein Jahr zeitgleich besessen habe, kann ich Folgendes darüber sagen:
In der Bildqualität sind beide fast ununterscheidbar, und zwar ab Offenblende. D.h. sie sind beide sehr, sehr gut. In diesem Teil brauchst du dir also keine Gedanken machen.
Was geringe Tiefenschärfe und Bokeh bzw. Freistellung angeht, sind beide ebenfalls ununterscheidbar. Sie haben beide eine fast identische Blendenöffnung (45mm vs 46,6mm), und ich konnte vom bloßen Angucken der Bilder nicht sagen, welches ich mit welchem Objektiv aufgenommen habe. Also auch hier Gleichstand.
Jetzt kommen wir zu den größeren Unterschieden:
Autofokus: Das 90mm f2 ist schneller. ABER das 56mm war mir bis auf schnelle Bewegung nie zu langsam. Egal ob Events oder Hochzeit, ich war mit den entsprechenden Kameras (X-T2 und X-H1) sehr zufrieden. Das 90mm ist halt bei Action-Shots einfach auf der Höhe der Zeit.
Wetterfestigkeit: Nur das 90mm f2 ist wirklich abgedichtet, und hält was es verspricht. Ich wurde einmal von einer Welle am Strand überrascht (komplett drüber), die X-H1 und das 90mm haben keine Mucken gemacht. Kurz mit stillem Wasser abgespült und ein paar Sandkörner rausgepult, und alles war gut.
Brennweite: Das ist wohl der entscheidende Unterschied. Zwischen 56mm und 90mm ist einfach ein großer Unterschied. Indoor werden 90mm schlicht zu lange werden, während du draußen mit dem 56mm einfach näher rangehst. Das vielseitigere Objektiv ist definitiv das 56mm. Wenn man noch reinrechnet, dass sie optisch und mit Freistellung gleichauf sind, liegt meine Empfehlung beim 56mm.
Kleinere Unterschiede:
Das 90mm ist schwerer und länger.
Für Porträt hat das 90mm den schönen Effekt, dass Gesichter schmaler wirken als beim 56mm. Das liegt am größeren Abstand zum Model, wenn man den gleichen Ausschnitt will. Ich hab das bevorzugt.
Das 56mm 1.2 hat bei Low Light natürlich die größeren Reserven, aber für mich war das nur nebensächlich. Kann bei dir natürlich das entscheidende Kriterium sein.
Wenn du das 90mm auch mal an nem unstabilisierten Body verwendest, brauchst du höhere Verschlusszeiten, um scharfe Bilder zu bekommen als beim 56mm (an ner X-H1 ist das irrelevant).
Fazit: Für das erste Porträt-Objektiv würde ich das 56mm empfehlen, da es einfach vielseitiger und vor allem drinnen einsetzbar ist. Brauchst du Wetterfestigkeit und Actiontauglichkeit, dann wäre es das 90mm.
P.S.: Beide Welten vereint übrigens das 50mm f2: Schneller AF, Wetterfest, keine zu lange Brennweite, optisch auf höchstem Niveau, einzig ein bisschen weniger Freistellung. Bezieh es mal als Option mit ein!