Du kannst den Phasen-AF weder aktivieren noch deaktivieren, nur ob die Punkte angezeigt werden oder nicht kannst du einstellen (das ist im Menü leider etwas missverständlich, da so verkürzt formuliert).
Die Kamera sollte eigentlich auch unterhalb Blende 9 nicht nur den Phasen-AF nutzen, sondern diesen zum schnellen Fokussieren nehmen und dann noch mal kurz mit dem Kontrast-AF kontrollieren (hatte ich jedenfalls bisher so verstanden).
Im Beispiel mit dem Baum denke ich, dass der Kontrast-AF den Hintergrund bevorzugt hat, weil der viel kontrastreicher ist. Darum ist es auch sinnvoll, keine unnötig großen AF-Felder zu wählen. Ich nehme immer das kleinste, so lange es geht. Wird das Licht schwächer und gibt es wenig Kontraste, so dass der AF nicht mehr flott arbeitet oder nichts findet, erst dann gehe ich auf das nächstgrößere Feld. Nur bei Action-Schnappschüssen nehme ich manchmal „breit“ im Zusammenhang mit C-AF, aber dann muss ich halt auch in mancher Fehlentscheidung meiner Kamera leben.