Bei internen jpeg-Einstellungen kann ich nicht wirklich weiterhelfen, da ich ausschließlich in Raw-Format fotografiere.
Meine Erfahrungen da sind aber, dass die Fuji-Bilder eine deutliche Umgewöhnung in der Nachbearbeitung bedürfen. In Ligthroom schärfe ich mit deutlich geringerem "Betrag", dafür aber deutlich höheren "Details". Bei höheren ISO-Werten verzichte ich ganz auf Schärfung. Macht man beim Schärfen was falsch, sieht man in homogenen Flächen (und im "Bokeh") ganz schnell Artefakte bis hin zu den berüchtigten Würmchen.
Grundsätzlich lassen sich aber auch mit Fuji ausgezeichnete Bilder machen
Oder noch kürzer: Die Bilder sind nicht schlechter, der Weg dahin ist nur etwas anders (und vielleicht auch schwieriger).