Ohne jede Zeile vorher gelesen zu haben, dieser Fehler kann beim Schreiben auf die Speicherkarte passieren, durch schlechten Kontakt der Karte im Cardreaders und durch Fehler der Karte selber.
Der TO schrieb aber ausdrücklich, dass der Fehler sowohl im RAW, als auch im eingebetteten jpg vorhanden ist. Somit würde ich von einem Fehler ausgehen, der bereits vor der Entwicklung des eingebetteten jpg und somit vor dem Speichern aufgetreten ist.