Ich würde auch mal vermuten das es etwas in dieser Richtung ist.Ist das ein älteres Sigma? Denn über die Kombination Canon und das Sigma 105 Makro gab es schon häufiger ähnliche Aussagen, gerade in den englischen Foren findet man da viel. Ein Firmwareupgrade des Objektivs kann wohl Abhilfe schaffen, aber dafür muss man halt zahlen und es einschicken - oder halt wissen, dass das Objektiv im "Fernbereich" ca. 1EV unterbelichtet und im Nahbereich ca. 2 EV und entsprechend korrigieren
Auch eine falsche Blendenübertragung oder Einstellungen im Objektiv könnte der Fall sein. Ich würde einfach mal die Kontakte zum Objektiv abkleben und sehen was die Kamera dann mit der Belichtungsmessung macht.