...Allerdings habe ich noch keinen Peil wie ich das dann ordentlich in Premiere importiert bekomme...
Erstell Deine After Effects Datei. Also den Teil den Du wiedergeben möchtest mit den entsprechenden Effekten (hier: MotionTracking). Abspeichern als AfterEffects Projektdatei und nach Premiere wechseln.
Jetzt kannst Du die Projektdatei über den Explorer in Dein Projekt ziehen und in die Schnittleiste legen.
Vorteil: Änderst Du jetzt noch was am MotionTracking brauchst Du in Premiere keine neue Datei einfügen, einfach die vorhandene Datei speichern und Premiere greift entsprechend immer auf die Datei zurück.
Am Ende einfach als Video entsprechend exportieren.