Es soll gehen. Immerhin kann man nach Markierung sortieren.
Das bedeutet nach dem Häkchen, das man selbst per Hand gesetzt hat (importieren oder nicht). Außer der Aufnahmezeit gibt es keine Möglichkeit, im Import-Dialog nach Kamera-Metadaten zu sortieren.
Kann man dann nicht einfach auf die markierten Bilder einen Filter setzen?
Nein, Lightroom bietet beim Import keinerlei Filter mit Ausnahme der Aufnahmezeit (wobei das kein eigentlicher Filter ist, sondern eher eine Gruppierung nach Zielordnern wie unter Ziel -> Ordnen eingestellt).
Den einzigen Pseudo-Filter, den man hat, ist die Sortierung nach Aufnahmezeit (siehe oben) und anschließendes Klick + Shift-Klick auf den Bereich, den man importieren möchte. Eine Filterung oder Sortierung nach andere Metadaten ist nicht möglich.
Sonst wäre es eine nette Fehlinvestition.
Wenn Du wirklich genau dieses eine spezielle Feature benötigts, dann befürchte ich, ist das der Fall.
Ansonsten gibt es ja noch den Umweg, erstmal alle Bilder zu importieren (mit Vorschauen rendern -> minimal geht das einen schnellen Kartenleser/USB-Verbindung vorausgesetzt bei nicht allzu vielen Bildern relativ fix) und dann in der Bibliothek die unmarkierten Bilder anzeigen zu lassen (direkt nach dem Import ist man im Pseudo-Ordner "letzter Import", es betrifft dann also nur wirklich die zuletzt importierten Bilder) und diese zu löschen. Einen entsprechenden Bibliotheksfilter kannst Du als Vorgabe ablegen, um ihn schnell aufrufen zu können.
P.S. Frage aus Interesse: Welches Metadatenfeld schreibt denn die Kamera beim Markieren? Ist das die Bewertung (Sterne) oder die Pick/Reject-Markierung? Es sollte schon etwas standardisiertes sein, damit LR das auch lesen kann - wovon ich aber mal stark ausgehe.