Das das Problem nicht mit Deinen beiden anderen Objektiven auftritt kann daran liegen daß Du mit denen nicht über die Brennweiter >200mm kommst.
Ideal wäre es wenn Du beide Kombinationen, Kamera mit einem anderen 100-400mm bzw. Dein 100-400mm an eine andere Kamera.
Damit kannst Du eingrenzen ob es tatsächlich nur an der Kombination Deine Kamera mit speziell diesem Objektiv liegt.
In einem älteren Testbericht habe ich diese Info bzgl. vertikaler Streifen, die hin und wieder auftreten, gefunden. Vielleicht hiflt der Tip mit sRAW ja zumindest als Test weiter:
"...Canon hat sich zu dem vieldiskutierten Problem der schwarzen Flecken geäußert, die die Canon EOS 5D Mark II bei Aufnahmen mit wenig Licht in besonders hellen Bildbereichen ('Highlights') produzierte. In einer Erklärung von Canon heißt es, die Firma sei dabei das Problem zu lösen und bringe demnächst ein Firmware Update auf den Markt. Außerdem zeigen die Ingenieure einen Weg auf, wie die ''schwarzen Flecken aus der Hölle'' schon bei der Aufnahme vermieden werden können. Zudem trat auch das Phänomen auf, dass die Aufnahmen vertikale Störstreifen zeigten.
Die ''schwarzen Flecken'' lassen sich wie folgt vermeiden: Der Fotograf muss die 'Highlight Priorität', die Dynamikoptimierung und die Rauschunterdrückung ausschalten, dann werden keine schwarzen Punkte abgebildet. Gegen die Störstreifen hilft, die Einstellung für sRAW2 zu benutzen. Bei sRAW1 treten die Störungen auf. Auch wer einfach Bilder im RAW- oder JPEG-Format aufnimmt, wird keine Probleme haben. Reduziert kann die Bildstörung auch werden, wenn man die Einstellung 'C.Fn II-3' (Highlight Priorität) auf '0' stellt, sie also ausschaltet....
Gruß
Reinhard